We wrześniu 1939 roku Państwowa Fabryka Związków Azotowych otrzymała niemiecki zarząd i nową nazwę „Stickstoffwerke Mościce”. Po dokonaniu drobnych napraw, zwłaszcza uszkodzonych zbiorników gazowych, okupanci zdecydowali o ponownym uruchomieniu fabryki, która  posiadała zapasy podstawowych surowców, zwłaszcza węgla, koksu i kamienia wapiennego. Fabrykę uruchomiono ponownie w październiku 1939 roku.[1]